基本操作
| スティック 十字キー |
カーソル選択、移動 |
| Aボタン | 手裏剣やクナイなどの忍術 |
| Bボタン | パンチやキックの体術 |
| Yボタン | 投げ |
| Xボタン | 奥義 |
| Zボタン | マルチ対戦でターゲット変更 |
| L・R | 避け(軸移動)、変わり身の術 |
| Cスティック | ｢修行｣で上に倒すと初期位置に戻る |
| チャクラ | 忍術を使うために必要なエネルギーのこと 攻撃したり防御してるとゲージがたまっていく 特殊技、変わり身の術、奥義に使用 |
| ガード | スティック(十字キー)を後ろに倒すか そのまま動かないでいる |
| ガードクラッシュ | 相手の攻撃をガードし続けると ガードエフェクトの色が青から黄、黄から赤に変化 そのまま続けるとガードが崩れてチャクラが0になる |
| 奥義 | チャクラゲージが満タンのときにX |
| 変わり身の術 | ダメージを受けているときにLかR 背後や上から反撃 (チャクラを75％消費) |
| 受け身 | 吹っ飛ばされて地面に落ちる瞬間にAかB |
| 投げ抜け | 相手に投げられる瞬間にボタンを押す |
| 奥義キャンセル | BB奥義でキャンセルが可能(全キャラ共通) 一部のキャラは他にもキャンセルがある |
| カウンター | こちらが攻撃モーションに入ったときに 相手の攻撃を受けるとダメージが増える |